Atualmente o Centro Nacional de Primatas possui em andamento 24 projetos de pesquisa cientifica, realizados por servidores da Instituição e pesquisadores de Instituições parceiras. Desses, 02 iniciaram-se em 2013, 01 em 2014, 09 em 2015 e 12 no ano de 2016. Entre os projetos de pesquisa de 2016, em destaque podemos citar os estudos sobre o Vírus Zika (ZIKV) em primatas não humanos, intitulados: “Avaliação morfológica por meio de ultrassonografia de fêmeas prenhas da espécie Saimiri collinsi infectadas experimentalmente com cepas do Vírus Zika (ZIKV)” da Médica veterinária Aline Amaral Imbeloni do CENP; e “Avaliação do potencial de proteção dos candidatos á vacina contra o vírus Zika em primatas não humanos do velho e do novo mundo” ambos sob orientação do Dr. Pedro Fernando da Costa Vasconcelos, Diretor do Instituto Evandro Chagas.

Tais projetos integram uma rede de pesquisas realizadas pelo Instituto Evandro Chagas e Centro Nacional de Primatas em parceria com a universidade do Texas Medical Branch, nos Estados Unidos, que estão desenvolvendo estudos sobre o ZIKV nos primatas não humanos do CENP, o objetivo de tais estudos é a avaliação e sequelas do vírus em grávidas e filhotes, assim como estudos pré-clínicos da vacina contra esse vírus, fruto dessa parceria. As perspectivas de estudos experimentais são enormes e ganharam celeridade na comunidade científica mundial, face aos impactos sociais e na saúde pública decorrentes principalmente da doença congênita causada pelo ZIKV.

Outros projetos em destaque realizado neste Centro foram os estudos sobre tratamentos para a leishmaniose cutânea, intitulados: “Desenvolvimento de medicamentos para o tratamento de Doenças Negligenciadas: Leishmanioses e avaliação do fármaco 18-METOXICORONARIDINA para o tratamento de todas as formas clínicas”, sob a coordenação do Dr. Fernando Tobias Silveira, Diretor substituto do Instituto Evandro Chagas, e responsabilidade técnica da Dra. Liliane Almeida Carneiro, Diretora do Centro Nacional de Primatas e parceria com a Hebron Farmacêutica de São Paulo; e “Ácido Kójico, um bioproduto com potencial terapêutico para o tratamento tópico da leishmaniose tegumentar: Ensaios pré-clínicos em primatas não humanos”, sob a coordenação da Dra. Edilene Oliveira da Silva, professora pesquisadora da Universidade Federal do Pará e responsabilidade técnica da Dra. Liliane Almeida Carneiro.  O objetivo desses estudos foi estudar a eficácia das drogas utilizadas contra a leishmaniose cutânea experimental causada por L. (L.) amazonensis em primatas não humanos, visto que os fármacos que estão no mercado apresentam uma série de problemas, como eficácia intermitente (possivelmente causada pelo desenvolvimento/seleção de parasitos resistentes) e indução de efeitos colaterais, que limitam a sua utilização e, principalmente, sua eficácia.